str檢測(cè)
短串聯(lián)重復(fù)(short tandem repeats, str),又稱微wei星dna(microsatellite dna)或簡(jiǎn)單重復(fù)序列(- repeat sequence, srs或ssr),pcr實(shí)驗(yàn)室,是廣泛存在于原核生物和真核生物基因組中的核苷酸重復(fù)序列。有絲分裂過程中dna鏈之間的錯(cuò)配引起的fu制滑動(dòng)被認(rèn)為是導(dǎo)致str產(chǎn)生的較為常見原因,廣西pcr,并且依據(jù)不同fu制單元大小的不同以及不同物種之間,fu制滑動(dòng)發(fā)生的概率也不相同。
str是以序列 (core repeat units) 首尾相連多次重復(fù)形成。每個(gè)str的序列結(jié)構(gòu)相同,長(zhǎng)度為2-6bp,但其重復(fù)單位數(shù)目和重復(fù)區(qū)域的長(zhǎng)度不同,因此str在不同種族、不同人群之間的分布具有差-,構(gòu)成了str遺傳多態(tài)性。不同個(gè)體之間在一個(gè)同源str位點(diǎn)的重復(fù)次數(shù)也不同,因而同指紋識(shí)別一樣,實(shí)時(shí)定量pcr,str位點(diǎn)分析也可對(duì)個(gè)體進(jìn)行身份識(shí)別。通過識(shí)別個(gè)體基因組在特定位點(diǎn)的特定序列重復(fù),即可創(chuàng)建其基因檔案。基于此,str分析法已經(jīng)成為一種重要的鑒定分析方法,應(yīng)用于-學(xué)、qin子鑒定及細(xì)胞鑒定等領(lǐng)域。
蛋白質(zhì)互作驗(yàn)證服務(wù)
在后基因組時(shí)代,-多少錢,基因的表達(dá)產(chǎn)物蛋白質(zhì)作為生物功能直接的執(zhí)行者和體現(xiàn)者,在生物集體的生理及病理中扮演著重要的角色。高通量的蛋白質(zhì)組學(xué)研究技術(shù)可以在上述過程中篩選出具有潛在價(jià)值的生物標(biāo)記和靶點(diǎn)。但是長(zhǎng)期以來,-的蛋白質(zhì)表達(dá)分析譜并沒有提升我們對(duì)生物標(biāo)志物的認(rèn)識(shí),其主要原因是差異蛋白的分析結(jié)果缺乏規(guī)模化的驗(yàn)證。
全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
全轉(zhuǎn)錄組是指特定組織或細(xì)胞在特定狀態(tài)下所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的總和,包括mrna和各種noncoding rna。我們知道生物體本身的轉(zhuǎn)錄過程是一個(gè)動(dòng)態(tài)變化且十分復(fù)雜的分子作用網(wǎng)絡(luò),如果只是對(duì)某個(gè)單一rna分子的研究,有時(shí)并不能準(zhǔn)確的發(fā)現(xiàn)分子作用機(jī)制。而競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源rna(cerna)理論闡述了一種全新的轉(zhuǎn)錄調(diào)控模式:cerna包括lncrna、circrna、mrna、假基因等分子能夠通過mirna應(yīng)答元件microrna respe element, mre競(jìng)爭(zhēng)性地結(jié)合相同的mirna來調(diào)節(jié)彼此的表達(dá)水平。舉個(gè)例子:mirna會(huì)導(dǎo)致基因沉默現(xiàn)象發(fā)生,而如果lncrna競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合了mirna,從而影響了mirna基因沉默功能實(shí)現(xiàn)。
cerna是目前轉(zhuǎn)錄調(diào)控領(lǐng)域的-內(nèi)容之一,通過全轉(zhuǎn)錄組研究能夠系統(tǒng)性的闡述cerna的分子作用機(jī)制。目前對(duì)全轉(zhuǎn)錄組簡(jiǎn)便的方法就是構(gòu)建2個(gè)測(cè)序-分別進(jìn)行測(cè)序。標(biāo)準(zhǔn)的生物信息學(xué)分析能夠得到mrna、lncrna、circrna、mirna各自的研究?jī)?nèi)容,靶向調(diào)控網(wǎng)絡(luò)、cerna網(wǎng)絡(luò)、共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析可以將這幾種rna聯(lián)合起來分析,從而發(fā)現(xiàn)新的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)模型。去除rrna的鏈特--,含有的rna信息含量十分豐富,通過測(cè)序和生物信息學(xué)分析能夠得到mrna、lncrna、circrna的鑒定及注釋信息。不過該-構(gòu)建時(shí)會(huì)進(jìn)行片段化選擇從而濾掉了small rna的信息,所以需要另外再構(gòu)建一個(gè)small rna-,進(jìn)行測(cè)序分析后可以得到mirna和其他small rna的鑒定及注釋信息。全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序方案路線圖如下所示: