線粒體測序
線粒體是真核生物的重要細胞器，是生物體的能量工廠，參與能量代謝、信號轉導、細胞凋亡等許多生命活動，對生物的生理活動起著---的作用。大部分線粒體基因由于其母系遺傳特性以及進化速率較快等特點，被廣泛地用于種群遺傳學、進化生物學、譜系地理學和系統發育學、---診斷等學科領域。線粒體全基因組在生物進化的研究中具有---的優勢。由于線粒體有著與真核生物長期共生的進化歷史，因此其基因組包含了反映物種進化的關鍵信息，同時，相對于核基因組，線粒體基因組小，pcr實驗室，容易對大量物種進行橫向的比較分析，有利于生物進化的研究，因而受到進化生物學家的---。線粒體的組成可以從兩個層面上反映物種及群體的遺傳和進化，即-序列組成和基因組的結構特征，兩者的特征具有不同的進化機制和進化速度，在進化生物學研究中可以---的互補。
甲l基化特---的pcr
herman 等 1996 在使用重---酸鹽處理的基礎上新建的一種方法。該方法敏感性高，主要用于作定性研究。用------鹽處理基因組dna，pcr檢測，所有未發生jia基化的胞嘧定被轉化為尿嘧ding，而jia基化的胞嘧定不變；隨后設計針對jia基化和非jia基化序列的引物進行pcr。通過電泳檢測msp擴增產物，如果用針對處理后jia基化dna鏈的引物能得到擴增片段，則說明該位點存在jia基化；反之，說明被檢測的位點不存在jia基化。
特點：適用范圍廣，能夠檢測特異位點是否發生jia基化。
------鹽測序法bisulfite sequencing pcr，bsp
------鹽修飾后測序法 bsp frommer 等 1992 提出的研究 dna jia基化方法，此方法---性及jing確度高，能明確目的片段中每一個 cpg 位點的jia基化狀態。用------鹽處理基因組dna，所有未發生jia基化的胞嘧ding被轉化為尿嘧ding，而jia基化的胞嘧ding不變。隨后設計bsp引物進行pcr，fish檢測，在擴增過程中尿嘧定全部轉化為胸腺嘧定，zui后對pcr產物進行測序就可以判斷cpg位點是否發生jia基化，稱為bsp-直接測序法。將pcr產物克long至載體后進行測序，可以提高測序成功率，這種方法稱為bsp-ke隆測序法。
特點：jing確度高，能夠準確檢測出jia基化的程度百分比。
mirna測序
microrna(mirna)是一種大小約21—23個堿基的單鏈小分子rna，銅川pcr，是由具有發夾結構的約70-90個堿基大小的單鏈rna前體經過dicer酶加工后生成，不同于sirna雙鏈但是和sirna密切相關。microrna通過和靶基因mrna堿基配對引導沉默復合體risc降解mrna或抑制mrna的翻譯，從而在轉錄后水平調控蛋白表達新發現mirna也能在轉錄水平調控基因表達。mirna在物種進化中相當保守，在動物、植物和---等中發現的mirna表達均有嚴格的組織特---和時序性。mirna在細胞生長和發育過程中起多種作用，包括調控發育、分化、凋亡和增殖等。
目前研究mirna的方法主要是realtime-pcr、生物芯片技術以及第二代測序技術。基于第二代測序技術的mirna測序，可以一次獲得數百萬條mirna序列，能夠快速鑒定出不同組織、不同發育階段、不同---狀態下已知和未知的mirna及其表達差異，為研究mirna對細胞進程的作用及其生物學影響提供了有力工具。
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