分子實驗介紹——熒光定量pcr檢測
熒光定量pcr是檢測生物樣品中rna含量的普遍的方法,通過熒光染料或熒光標記的特-的探針,對pcr產物進行標記-,pcr引物設計,實時在線監控反應過程,結合相應的軟件可以對產物進行分析,計算待測樣品模板的初始濃度。目前主要使用sybr green和taqman法對rna含量進行檢測。sybr green在低樣本量時成本較低,目前選用的較多。
sybr green i是一種只與dna雙鏈結合的熒光染料。當它與dna雙鏈結合時,發出熒光;從dna雙鏈上釋放出來時,熒光信號急劇減弱。因此,在一個體系內,其信號強度代表了雙鏈dna分子的數量。sybr green熒光染料-量pcr的基本過程是:1、開始反應,當sybr green染料與dna雙鏈結合時發出熒光。2、dna變性時,sybr green染料釋放出來,熒光急劇減少。3、在聚合延伸過程中,引物退火并形成pcr產物。4、聚合完成后,熒光定量pcr,sybr green染料與雙鏈產物結合,定量pcr系統檢測到熒光的凈增量加大。
實驗流程:細胞或組織rna提取-rna濃度檢測-rna逆轉錄-定量pcr檢測。
結果示例:
圖 a 基因擴增曲線圖;b 基因擴增溶解曲線圖;c mrna相對表達量變化
從圖中可以擴增曲線可以看出目的rna擴增效果,溶解曲線可以看出引物識別特-情況,通過使用δδct方法計算可以得到每個組中目的mrna表達變化。
分子生物學檢測服務
隨著生命科學和化學的不斷發展,pcr,人們對生物體的認知已經逐漸深入到微觀水平。從單個的生物體到qi官到組織到細胞,再從細胞結構到-和蛋白的分子水平,人們意識到可以通過檢測分子水平的線性結構如-序列,來橫向比較不同物種,同物種不同個體,同個體不同細胞或不同生理病理狀態的差異。這就為生物學和醫學的各個領域提供了技術平臺。分子生物學檢測技術是現代分子生物學與分子遺傳學取得進步的結晶,是在人們對基因的結構以及基因的表達和調控等生命本-題的認識日益加深的基礎上產生的。近年來,分子生物學檢測技術的方法學研究取得了進展,先后建立了各種分子生物學檢測技術。
emsa實驗
emsa:凝膠遷移或電泳遷移率檢測是一種檢測蛋白質和dna序列相結合的技術,初用于研究dna結合蛋白和其相關的dna結合序列相互作用,可用于定性和定量分析。分為2種類型:同位素標記探針,實時定量pcr,非同位素標記探針。
通常將純化的蛋白和細胞粗提液和32p同位素標記的dna或rna探針一同保溫,在非變性的聚bing烯凝膠電泳上,分離復合物和非結合的探針。dna-復合物或rna-復合物比非結合的探針移動得慢。同位素標記的探針依研究的結合蛋白的不同,可是雙鏈或者是單鏈。當檢測如轉錄調控因子一類的dna結合蛋白,可用純化蛋白,部分純化蛋白,或核細胞抽提液。在檢測rna結合蛋白時,依據目的rna結合蛋白的位置,可用純化或部分純化的蛋白,也可用核或胞質細胞抽提液。競爭實驗中采用含蛋白結合序列的dna或rn片duan和gua核苷酸片段特異,和其它非相關的片段非特異,來確定dna或rna結合蛋白的特-。在競爭的特異和非特異片段的存在下,依據復合物的特點和強度來確定特異結合。