沼氣工程設備的定期維護保養是發揮沼氣工程效益的重要環節。有些沼氣工程建成后，由于維護管理不當，造成沼氣工程不能有效運行，因此應當加強設備的維護和保養。
1格柵
應定期檢修、保養格柵，對于破損的要及時更換。機械格柵機運轉結束后應及時清洗格柵機。
2泵房
在每次停泵后，應檢查填料或油封處的密封情況，進行---的處理，并根據需要添加或更換填料、潤滑油、潤滑脂。
應至少半---查、調整、更換水泵進出水閘閥與填料1次。
應定期檢修集水池水標尺或液位計及其轉換裝置。
備用泵應每月至少進行1次試運轉。環境溫度低于0℃時，必須放掉泵殼內的存水。
調節池
連接貯存池的管道應定期清理。
調節池應每年放空、清理1次，及時排除沉渣及雜物。
正常運轉后，每年排泥1~2次，應經常檢查排泥閥，并進行保養。
厭氧反應器
厭氧反應器的塔體、各種管道及閘閥應每年進行1次檢查和維修。
厭氧反應器的各種加熱設備應經常除垢、清通。
當采用熱交換器加熱時，管道和閘閥處的密封材料應每年更換。
當采用螺旋槳等機械攪拌時，軸承應定期檢查，添加潤滑油，支承架的連接螺栓應經常檢查和緊固。
蒸氣管道、沼氣管道的冷凝水應按設計規定定期排放。
寒冷地區冬季，對溢流管、防爆裝置的水封應做好設備和管道保溫防凍工作。
厭氧反應器運行3~5年應清理、檢修1次。
沼氣工程設備故障排除方法
沼氣池原料：
沼氣池啟動時，初次加入堆漚發酵的原料，原料液面上不產生串珠狀氣泡， 或者液面上出現一層白色膜狀物，類似于酸菜容器中的膜狀物，表明原料是消毒糞或者原料中的酸性過強。
排除方法：抽出全部原料，用合格牛糞進行堆漚發酵重新啟動，或者將原料抽出1~2米3,從正常使用的沼氣池中抽取等量沼渣加入，使沼液酸堿度趨于正常值，逐漸產生沼氣。
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